哈氏異康吉鰻會將頭朝向水流的方向，吃下順流而來的浮游動物。察覺危險時，哈氏異康吉鰻會立即將全身藏入沙中。牠們平時會將近半的身子藏在沙裡，身體全長大約有30公分。